Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 RAD52YML032C 1416 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 VAC17YCL063W 1272 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YCL075WYCL075W 441 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YDR056CYDR056C 618 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YDR282CYDR282C 1245 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 SPO73YER046W 432 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YLR225CYLR225C 1224 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 DCS1YLR270W 1053 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 GCD7YLR291C 1146 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 CCS1YMR038C 750 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YPL025CYPL025C 558 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 POP4YBR257W 840 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 SMP3YOR149C 1551 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YCR023CYCR023C 1836 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YLR152CYLR152C 1731 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC28P40509 GZF3YJL110C 1656 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC28P40509 LOH1YJL038C 660 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC28P40509 RAD27YKL113C 1149 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC28P40509 DBR1YKL149C 1218 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YLR407WYLR407W 687 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC28P40509 ICY2YPL250C 411 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC28P40509 CNS1YBR155W 1158 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC28P40509 ROK1YGL171W 1695 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC28P40509 TCO89YPL180W 2400 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC28P40509 NUS1YDL193W 1128 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC28P40509 RPP0YLR340W 939 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YPT53YNL093W 663 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC28P40509 VPS28YPL065W 729 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC28P40509 GCR1YPL075W 2358 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC28P40509 MTR10YOR160W 2919 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC28P40509 URC2YDR520C 2319 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC28P40509 BCK2YER167W 2556 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC28P40509 CTR86YCR054C 1692 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC28P40509 SAF1YBR280C 1914 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC28P40509 NUG1YER006W 1563 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC28P40509 SKG6YHR149C 2205 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC28P40509 PRE9YGR135W 777 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YKL177WYKL177W 339 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC28P40509 JHD2YJR119C 2187 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC28P40509 ALO1YML086C 1581 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC28P40509 BNA6YFR047C 888 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC28P40509 FMP46YKR049C 402 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC28P40509 CDA2YLR308W 939 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC28P40509 HTA2YBL003C 399 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC28P40509 TAF4YMR005W 1167 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YNL217WYNL217W 981 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YPL278CYPL278C 303 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YPK3YBR028C 1578 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC28P40509 BUD5YCR038C 1929 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YMR1YJR110W 2067 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 SRO9YCL037C 1305 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 SPB4YFL002C 1821 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YEH2YLR020C 1617 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YDL094CYDL094C 510 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 ATP5YDR298C 639 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 PAD1YDR538W 729 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 RPL24AYGL031C 468 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YIL171WYIL171W 330 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 NMD4YLR363C 657 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YLR428CYLR428C 345 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 FOL3YMR113W 1284 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 SNF2YOR290C 5112 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 CEG1YGL130W 1380 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 RAD7YJR052W 1698 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC28P40509 PHM7YOL084W 2976 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YCL068CYCL068C 783 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YNK1YKL067W 462 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC28P40509 PAM18YLR008C 507 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YLR049CYLR049C 1287 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC28P40509 RRN9YMR270C 1098 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC28P40509 TOM7YNL070W 183 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC28P40509 AIM39YOL053W 1188 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC28P40509 LAS1YKR063C 1509 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC28P40509 HOYDL227C 1761 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC28P40509 XKS1YGR194C 1803 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 SEN1YLR430W 6696 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 NOP6YDL213C 678 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 THI13YDL244W 1023 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 NBP2YDR162C 711 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YGL188CYGL188C 174 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 CLC1YGR167W 702 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 FMC1YIL098C 468 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 THI11YJR156C 1023 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 GPI12YMR281W 915 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 RER1YCL001W 567 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 RSC3YDR303C 2658 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 BUD6YLR319C 2367 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 SMF1YOL122C 1728 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC28P40509 PEX30YLR324W 1572 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC28P40509 GAT2YMR136W 1683 nt4.23□□□□□ -1.73
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