Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms