Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF2E1P29083 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms