Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VDAC1P21796 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms