Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNE2O96020 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms