Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
N4BP3O15049 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms