Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMG1C9JSJ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms