Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RCCD1A6NED2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms