Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms