Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms