Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms