Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms