Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT9

IKZF3, Zinc finger protein Aiolos, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF3Q9UKT9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IKZF3Q9UKT9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms