Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms