Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD2Q9HC29 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms