Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.1 ms