Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INPP4AQ96PE3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms