Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC44A1Q8WWI5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A1Q8WWI5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A1Q8WWI5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A1Q8WWI5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A1Q8WWI5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A1Q8WWI5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms