Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX3LQ8TDB6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms