Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC181Q5TID7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms