Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms