Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf17Q53FE4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf17Q53FE4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms