Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms