Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18Q15532 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18Q15532 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18Q15532 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18Q15532 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18Q15532 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18Q15532 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18Q15532 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SS18Q15532 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SS18Q15532 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SS18Q15532 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SS18Q15532 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SS18Q15532 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms