Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB35Q15286 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms