Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	Q05541	ARF2	YDL137W	546 nt		5.76	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	HSP150	YJL159W	1242 nt		5.76	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YNL057W	YNL057W	333 nt		5.76	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YBL096C	YBL096C	309 nt		5.76	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YOR097C	YOR097C	528 nt		5.76	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	HSP82	YPL240C	2130 nt		5.76	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	APA1	YCL050C	966 nt		5.76	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	MEF2	YJL102W	2460 nt		5.76	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	DAS2	YDR020C	699 nt		5.75	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	CNL1	YDR357C	369 nt		5.75	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	ERG25	YGR060W	930 nt		5.75	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YGR270C-A	YGR270C-A	219 nt		5.75	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	BET1	YIL004C	429 nt		5.75	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YNK1	YKL067W	462 nt		5.75	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YAL066W	YAL066W	309 nt		5.75	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YMR315W	YMR315W	1050 nt		5.75	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	SOL1	YNR034W	966 nt		5.75	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YBR013C	YBR013C	390 nt		5.75	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	ECM23	YPL021W	564 nt		5.75	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	snR32	snR32	188 nt		5.75	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	PRO2	YOR323C	1371 nt		5.75	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	NOP58	YOR310C	1536 nt		5.74	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	LEU1	YGL009C	2340 nt		5.74	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	RDI1	YDL135C	609 nt		5.74	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		5.74	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YER067C-A	YER067C-A	324 nt		5.74	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	NPY1	YGL067W	1155 nt		5.74	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	LYS5	YGL154C	819 nt		5.74	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	MRM1	YOR201C	1239 nt		5.74	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	CPA1	YOR303W	1236 nt		5.74	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	BMT2	YBR141C	1014 nt		5.74	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	RPS9B	YBR189W	588 nt		5.74	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	RTC1	YOL138C	4026 nt		5.74	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	SSA2	YLL024C	1920 nt		5.74	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	Q0255	Q0255	1419 nt		5.74	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YMR196W	YMR196W	3267 nt		5.73	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	CST6	YIL036W	1764 nt		5.73	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	CBF5	YLR175W	1452 nt		5.73	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	SOL3	YHR163W	750 nt		5.73	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	ACP1	YKL192C	378 nt		5.73	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YLR307C-A	YLR307C-A	264 nt		5.73	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	PRX1	YBL064C	786 nt		5.73	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YOL107W	YOL107W	1029 nt		5.73	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	CIN5	YOR028C	888 nt		5.73	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	LDH1	YBR204C	1128 nt		5.73	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	PWP1	YLR196W	1731 nt		5.73	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	TUB3	YML124C	1338 nt		5.73	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	FRS1	YLR060W	1788 nt		5.72	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YCR050C	YCR050C	309 nt		5.72	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YER133W-A	YER133W-A	342 nt		5.72	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YGL177W	YGL177W	348 nt		5.72	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	POL32	YJR043C	1053 nt		5.72	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	THI80	YOR143C	960 nt		5.72	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	ARA1	YBR149W	1035 nt		5.72	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	MIH1	YMR036C	1665 nt		5.72	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	RCK2	YLR248W	1833 nt		5.71	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	HSE1	YHL002W	1359 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	MSA1	YOR066W	1890 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	PXA1	YPL147W	2613 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	SED4	YCR067C	3198 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	YEL067C	YEL067C	588 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	VMA22	YHR060W	546 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	YLR163W-A	YLR163W-A	114 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	HAT1	YPL001W	1125 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	snR189	snR189	189 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	YPR071W	YPR071W	636 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	RKM3	YBR030W	1659 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	SUP35	YDR172W	2058 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	RPN6	YDL097C	1305 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	SEC39	YLR440C	2130 nt		5.71	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	ECM18	YDR125C	1362 nt		5.7	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	SLS1	YLR139C	1932 nt		5.7	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	PUF2	YPR042C	3228 nt		5.7	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	CPR1	YDR155C	489 nt		5.7	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	TAF10	YDR167W	621 nt		5.7	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	YDR509W	YDR509W	348 nt		5.7	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	YBL029C-A	YBL029C-A	285 nt		5.7	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	snR10	snR10	245 nt		5.7	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	PMT4	YJR143C	2289 nt		5.69	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	SYP1	YCR030C	2613 nt		5.69	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	YCL068C	YCL068C	783 nt		5.69	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	YCR100C	YCR100C	951 nt		5.69	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	KIN28	YDL108W	921 nt		5.69	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	CUP1-1	YHR053C	186 nt		5.69	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	CUP1-2	YHR055C	186 nt		5.69	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	UBI4	YLL039C	1146 nt		5.69	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	YAR023C	YAR023C	540 nt		5.69	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	GPN3	YLR243W	819 nt		5.69	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	PML39	YML107C	1005 nt		5.69	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	YBR056W-A	YBR056W-A	201 nt		5.69	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	YCL012C	YCL012C	405 nt		5.69	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	ECM32	YER176W	3366 nt		5.69	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	FZO1	YBR179C	2568 nt		5.68	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	CEG1	YGL130W	1380 nt		5.68	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	CPS1	YJL172W	1731 nt		5.68	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	SSH4	YKL124W	1740 nt		5.68	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	KCC4	YCL024W	3114 nt		5.68	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	SUL2	YLR092W	2682 nt		5.68	□□□□□ -1.5
NSE3	Q05541	ALG6	YOR002W	1635 nt		5.68	□□□□□ -1.5

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