Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A1P68400 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms