Protein–RNA interactions for Protein: P32572

SPS18, Sporulation protein SPS18, yeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS18	P32572	TRM11	YOL124C	1302 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	VAC17	YCL063W	1272 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	HSP42	YDR171W	1128 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	RPL24A	YGL031C	468 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	PIR3	YKL163W	978 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	RRN9	YMR270C	1098 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	ISA2	YPR067W	558 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	ALG11	YNL048W	1647 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	SEG1	YMR086W	2883 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	SNF2	YOR290C	5112 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	VMA1	YDL185W	3216 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	NGL3	YML118W	1518 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	APC1	YNL172W	5247 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	DIP2	YLR129W	2832 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	BUD8	YLR353W	1812 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	ECM22	YLR228C	2445 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	OCA4	YCR095C	1089 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	YDL094C	YDL094C	510 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	GAT3	YLR013W	426 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	YOR379C	YOR379C	339 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	PWR1	PWR1	941 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	GAL11	YOL051W	3246 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	CEG1	YGL130W	1380 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	LAS1	YKR063C	1509 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	CDC14	YFR028C	1656 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	TPA1	YER049W	1935 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	ALE1	YOR175C	1860 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	ALO1	YML086C	1581 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	PAD1	YDR538W	729 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	SPO73	YER046W	432 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	YGL262W	YGL262W	528 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	GVP36	YIL041W	981 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	ACP1	YKL192C	378 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	YLR428C	YLR428C	345 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	BSD2	YBR290W	966 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	UBP10	YNL186W	2379 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	SPC105	YGL093W	2754 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	TEL1	YBL088C	8364 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	ROK1	YGL171W	1695 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	RKM3	YBR030W	1659 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	GPB1	YOR371C	2694 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	YRB30	YGL164C	1323 nt		3.46	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	MIH1	YMR036C	1665 nt		3.46	□□□□□ -1.85
SPS18	P32572	PUF2	YPR042C	3228 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	YEL028W	YEL028W	462 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	YIL171W	YIL171W	330 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	EFB1	YAL003W	621 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	AIM22	YJL046W	1230 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	SUI1	YNL244C	327 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	RPS19A	YOL121C	435 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	PEP4	YPL154C	1218 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	ARO80	YDR421W	2853 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	GLO3	YER122C	1482 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	YRM1	YOR172W	2361 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	GDH2	YDL215C	3279 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	DBP3	YGL078C	1572 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	ATG2	YNL242W	4779 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	TAF7	YMR227C	1773 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	YLR345W	YLR345W	1530 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	API2	YDR525W	330 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	SIW14	YNL032W	846 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	FKH1	YIL131C	1455 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	STB3	YDR169C	1542 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	VPS45	YGL095C	1734 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	KIP3	YGL216W	2418 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	GEM1	YAL048C	1989 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	PRP9	YDL030W	1593 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	SRP40	YKR092C	1221 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	SNO1	YMR095C	675 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	SMF1	YOL122C	1728 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	MMT1	YMR177W	1533 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	FAS2	YPL231W	5664 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	SPT23	YKL020C	3249 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	AIM21	YIR003W	2040 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	DIN7	YDR263C	1293 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	CNB1	YKL190W	528 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	YLR156W	YLR156W	345 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	YLR159W	YLR159W	345 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	YLR161W	YLR161W	345 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	SHE1	YBL031W	1017 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	IDH2	YOR136W	1110 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	POC4	YPL144W	447 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	VPS69	YPR087W	321 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	STP22	YCL008C	1158 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	MSK1	YNL073W	1731 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	KRE5	YOR336W	4098 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	SIR1	YKR101W	1965 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	TCM62	YBR044C	1719 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	KRE29	YER038C	1395 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	YAR023C	YAR023C	540 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	SEC72	YLR292C	582 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	YML031C-A	YML031C-A	336 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	HEK2	YBL032W	1146 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	VPS68	YOL129W	555 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SPS18	P32572	CMR3	YPR013C	954 nt		3.42	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 64 ms