Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA6P31267 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA6P31267 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms