Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP3P12645 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP3P12645 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP3P12645 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP3P12645 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP3P12645 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP3P12645 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BMP3P12645 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BMP3P12645 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BMP3P12645 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BMP3P12645 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BMP3P12645 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BMP3P12645 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BMP3P12645 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BMP3P12645 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BMP3P12645 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BMP3P12645 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BMP3P12645 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BMP3P12645 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BMP3P12645 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BMP3P12645 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BMP3P12645 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BMP3P12645 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BMP3P12645 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BMP3P12645 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BMP3P12645 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BMP3P12645 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BMP3P12645 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP3P12645 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BMP3P12645 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BMP3P12645 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BMP3P12645 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BMP3P12645 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BMP3P12645 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BMP3P12645 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BMP3P12645 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BMP3P12645 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP3P12645 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP3P12645 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP3P12645 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP3P12645 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP3P12645 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP3P12645 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP3P12645 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP3P12645 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP3P12645 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP3P12645 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP3P12645 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP3P12645 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP3P12645 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP3P12645 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BMP3P12645 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BMP3P12645 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BMP3P12645 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BMP3P12645 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BMP3P12645 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BMP3P12645 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BMP3P12645 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BMP3P12645 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BMP3P12645 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BMP3P12645 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BMP3P12645 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BMP3P12645 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BMP3P12645 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BMP3P12645 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BMP3P12645 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BMP3P12645 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BMP3P12645 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BMP3P12645 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BMP3P12645 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BMP3P12645 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BMP3P12645 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BMP3P12645 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BMP3P12645 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BMP3P12645 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BMP3P12645 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BMP3P12645 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BMP3P12645 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BMP3P12645 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BMP3P12645 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMP3P12645 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMP3P12645 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMP3P12645 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMP3P12645 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms