Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DMDP11532 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DMDP11532 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DMDP11532 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DMDP11532 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DMDP11532 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DMDP11532 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DMDP11532 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DMDP11532 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DMDP11532 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DMDP11532 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DMDP11532 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DMDP11532 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DMDP11532 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DMDP11532 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DMDP11532 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DMDP11532 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DMDP11532 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DMDP11532 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DMDP11532 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DMDP11532 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DMDP11532 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DMDP11532 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DMDP11532 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DMDP11532 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DMDP11532 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DMDP11532 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DMDP11532 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DMDP11532 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DMDP11532 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DMDP11532 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DMDP11532 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DMDP11532 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DMDP11532 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DMDP11532 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DMDP11532 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DMDP11532 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DMDP11532 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DMDP11532 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DMDP11532 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DMDP11532 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DMDP11532 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DMDP11532 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DMDP11532 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DMDP11532 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DMDP11532 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DMDP11532 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DMDP11532 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DMDP11532 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DMDP11532 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DMDP11532 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DMDP11532 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DMDP11532 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DMDP11532 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DMDP11532 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DMDP11532 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DMDP11532 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DMDP11532 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DMDP11532 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMDP11532 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DMDP11532 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMDP11532 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMDP11532 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMDP11532 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMDP11532 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DMDP11532 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMDP11532 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMDP11532 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMDP11532 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMDP11532 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMDP11532 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMDP11532 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMDP11532 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMDP11532 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMDP11532 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMDP11532 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMDP11532 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DMDP11532 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DMDP11532 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMDP11532 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMDP11532 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMDP11532 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMDP11532 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMDP11532 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMDP11532 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMDP11532 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMDP11532 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMDP11532 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMDP11532 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMDP11532 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMDP11532 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMDP11532 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMDP11532 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMDP11532 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMDP11532 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMDP11532 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMDP11532 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMDP11532 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMDP11532 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMDP11532 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms