Protein–RNA interactions for Protein: P0CI26

TRIM49C, Tripartite motif-containing protein 49C, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49CP0CI26 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms