Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN7O94888 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms