Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40AO75400 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40AO75400 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms