Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DFFAO00273 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DFFAO00273 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DFFAO00273 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DFFAO00273 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DFFAO00273 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DFFAO00273 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DFFAO00273 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DFFAO00273 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DFFAO00273 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFAO00273 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFAO00273 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFAO00273 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFAO00273 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFAO00273 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFAO00273 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFAO00273 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFAO00273 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFAO00273 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFAO00273 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFAO00273 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFAO00273 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFAO00273 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFAO00273 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DFFAO00273 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DFFAO00273 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DFFAO00273 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DFFAO00273 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DFFAO00273 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DFFAO00273 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DFFAO00273 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DFFAO00273 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DFFAO00273 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DFFAO00273 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DFFAO00273 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DFFAO00273 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFAO00273 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFAO00273 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DFFAO00273 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DFFAO00273 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DFFAO00273 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DFFAO00273 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DFFAO00273 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DFFAO00273 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DFFAO00273 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DFFAO00273 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms