Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L9A6NEM1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms