Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN7Q9Y6W3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms