Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB6Q9Y5E3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB6Q9Y5E3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms