Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A1Q9Y2Q0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms