Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDP2Q9P2J9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP2Q9P2J9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDP2Q9P2J9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PDP2Q9P2J9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDP2Q9P2J9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDP2Q9P2J9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDP2Q9P2J9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDP2Q9P2J9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDP2Q9P2J9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms