Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms