Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNPLA3Q9NST1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PNPLA3Q9NST1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNPLA3Q9NST1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms