Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA1Q9NP55 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BPIFA1Q9NP55 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms