Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UPF3BQ9BZI7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPF3BQ9BZI7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms