Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRA6Q9BX79 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms