Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms