Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms