Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms