Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIRT1Q96EB6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms