Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX3LQ8TDB6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms